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精準醫療正加速成為臺灣醫療體系的下一階段關鍵戰略。面對次世代基因定序（NGS）上路後暴增的資料量與分析需求，亞東紀念醫院攜手臺灣微軟與亞大基因科技（ATGENOMIX），將核心基因定序系統落地Azure臺灣區域，導入云原生架構與GPU加速運算，成為臺灣首家將核心基因定序系統上云的第一級醫學中心。此舉不僅大幅提升基因分析與臨床決策效率，更樹立醫療云端落地的新標竿。

圖左至右為亞大基因科技執行長暨創辦人張明臺、亞東紀念醫院醫學研究部主任吳彥雯、亞東紀念醫院??院長張至宏、臺灣微軟云專案總經理蔡??裕、臺灣微軟公共業務事業群健康與醫療產業總監劉致宏。

亞東醫院與臺灣微軟及亞大基因科技合作，打造「亞東精準醫療永續平臺」，完成核心基因定序云端系統建置。平臺采用Microsoft Azure臺灣區域資料中心，以可彈性擴充的算力、低延遲云端環境與自動化分析流程，加速海量基因資料的運算與解讀，協助院方強化對高風險族群的早期辨識、追蹤與健康管理。此合作亦讓亞東醫院成為亞洲首家將癌癥與遺傳罕見疾病基因定序分析全面部署於Azure的醫學中心，象徵臺灣在精準醫療與醫療云服務落地的重大突破。

隨著健保署自2024年將NGS納入給付，每年預估將有超過2萬名癌友受惠。NGS檢測一次可產生約 100GB 原始資料，須透過復雜的資料處理、轉換與比對流程，才能萃取與疾病相關的變異點。然而基因定序資料量龐大，使傳統院內運算資源面臨瓶頸，成為推動精準醫療的關鍵挑戰。

亞東醫院醫學研究部已建立大型基因資料庫，累積逾一萬名受檢者的定序資料，并啟動院內精準醫療計畫。院長邱冠明表示，疫情期間院方即成功吸引一萬多位民眾叁與生物資料庫與精準醫學計畫，「未來將持續推動資料流程建立，并拓展至合作醫療機構與社區場域，讓更多民眾受惠。」

在技術架構上，亞東采用ATGENOMIX的Seqslab Bio-IT平臺，結合Azure Data Lake Storage Gen2、Azure Database for MySQL、AKS、Azure Container Services、Azure Batch等服務，使系統能以自動化流程處理大規模基因資料。整體架構亦通過ISO 27001、27018、13485、62304等國際標準，強化資安治理與數據管理。

云原生架構讓龐大基因資料得以更快轉換成臨床洞見，強化醫院決策速度與資料安全。臺灣微軟總經理卞志祥指出：「亞東醫院將核心基因定序分析資料湖庫落地Azure臺灣區域，不僅開創醫學中心上云先例，更是亞洲首例在Azure部署癌癥與罕病基因分析的案例。」

為提升定序分析效能，亞東醫院亦將NVIDIA Parabricks GPU加速工具整合至系統。在80臺搭載T4 GPU的Azure NC8as_T4_v3 VM上，30X深度全基因定序（WGS）變異偵測可從過去CPU的4小時縮短至10分鐘，效能提升超過20倍。若進行2,500人的大規模全基因體定型（WGG）聯合分析，亦可在40小時內完成，相較傳統方法的約一個月大幅縮短時間。

在查詢效率上，亞東醫院目前資料湖庫涵蓋逾一萬名受試者、累積90億筆變異資料。透過云端加速，SQL查詢時間由140秒降至12秒，每月約千筆查詢可節省大量臨床等候時間，直接提升基因分析與醫療決策效率。系統落地臺灣也強化資料安全與合規性。所有數據均儲存於Azure臺灣區域，可避免跨境傳輸風險，并降低延遲，讓分析與查詢更即時。

目前亞東醫院已在心血管、神經、罕見疾病以及癌癥照護領域應用此系統，并將拓展至腸道菌基因與失智癥研究。院方表示將持續推動精準健康管理與醫療云端實證，期??成為臺灣個人化精準醫療的重要示范機構。